一般的肾结石、输尿管结石和膀胱结石可以采用体外冲击波碎石法进行碎石，或采用医用钬激光、医用钕激光、气压弹道碎石等方法碎石。体外冲击波碎石、超声碎石只对约15%的易碎的小结石有效。医用钬激光、医用钕激光以及气压弹道碎石可以解决约80%结石病人的治疗难题。这些治疗方法借助膀胱镜、输尿管软镜进行，激光光纤或设备的治疗端通过尿道抵达结石部位，然后专家操纵激光能量或气压弹道碎石能量，将结石击碎。以上这几种方法都无需开刀，对人体无损伤或损伤极小，是绝大多数结石如肾结石、输尿管结石和膀胱结石病人都愿意接受的治疗方法。缺点是上述治疗方法对部分肾结石，尤其是顽固坚硬的肾下盏结石和膀胱结石常常无能为力，而且治疗时只能碎石，不能当场清石，留下结石复发和碎石堵塞尿路的隐患。