肝内胆管结石的病因、病理改变比较复杂，既有肝脏的病变，又有胆管的病变，结石的复发率非常高。该病的治疗原则要求解除梗阻、祛除病灶和通畅引流三管齐下，只有采取综合措施，才能彻底治愈该病。

      在治疗前，首先要弄清结石在肝内的分布，是在肝的一侧还是两侧，是在一段肝还是多段肝，所在的肝组织是否有萎缩，有无脓肿，胆管的出口是否狭窄等。

      肝内胆管结石的治疗以外科手术为主要手段，如果肝脏没有萎缩，可以通过胆道镜取石；对于较大的出现嵌顿的结石，可用液电碎石机击碎结石后再用胆道镜取石。对于胆道狭窄可用胆道镜气囊扩张或水囊扩张后解除。

      采用该方法治疗可使残石率由以前的40%左右下降到5%。治疗时对于那些萎缩病变的肝脏，应和结石一并切除，有的患者担心切除肝脏以后影响以后的恢复，其实发生病变的肝脏已无功能，反而是病灶。此外，肝脏的再生能力强，恢复快，不会对肝功能造成损害。